Pomidor jigarrang rugoza meva virusi butun dunyo bo'ylab pomidor va qalampir o'simliklarini yuqtirgani sababli, urug'lik kompaniyalari chidamli pomidorni ko'paytirish ustida ishlamoqda.
Boy genetik va genomik resurslar pomidor selektsionerlari uchun pomidorning genomik sekvensiyasi loyihalari boshlanishidan oldin ham mavjud edi. Pomidor germplazmasining yirik to'plamlari uzoq vaqtdan beri bir necha joylarda tashkil etilgan. Dunyo bo'ylab genbanklarda 75,000 XNUMX dan ortiq pomidor qo'shilishi saqlanadi. Eng yiriklaridan biri Jeneva, Nyu-Yorkdagi USDA genbankidir.
Pomidor genomini ketma-ketlashtirish 2005 yilda 14 mamlakat o'rtasida ko'p millatli sa'y-harakatlar sifatida boshlangan va 2012 yilda yakunlangan. Bu harakatlar katta miqdordagi genetik va fenotipik ma'lumotlarni tahlil qilish uchun sun'iy intellekt, mashinani o'rganish va ilg'or algoritmlarni qo'llash orqali sezilarli darajada tezlashdi.
Pomidor pan-genomi
Boys Tompson instituti tadqiqotchilari 2020 yilda yovvoyi pomidorlar uchun toʻliqroq va foydali pomidor pan-genomini ishlab chiqarish uchun yuqori sifatli mos yozuvlar genomini yaratdilar. Ular genomning meva ta'mi, hajmi va pishishi, stressga chidamliligi va kasalliklarga chidamliligi asosida yotadigan bo'limlarini topdilar. Qisman DNKning juda uzun qismlarini o'qiy oladigan ilg'or ketma-ketlik texnologiyalari tufayli, mos yozuvlar genomi mavjud ma'lumotlar bazasiga qaraganda to'liqroq va aniqroqdir.
Qisqaroq DNK bo'laklarini o'qiydigan eski ketma-ketlik texnologiyalari mutatsiyalarni bitta bazaviy darajada aniqlaydi. Biroq, ular DNKning katta bo'laklarini kiritish, o'chirish, inversiya yoki dublikatsiya kabi strukturaviy variantlarni topishda yaxshi emas.
2019 yilda xalqaro tadqiqotchilar guruhi 725 filogenetik va geografik jihatdan reprezentativ navlarning genom ketma-ketligidan foydalangan holda pomidor pan-genomini yaratdilar. Ushbu ma'lumotlar bazasi original mos yozuvlar genomida topilmagan 4,873 genni o'z ichiga oladi. Mavjud/yo'q o'zgaruvchanlik tahlillari pomidorni xonakilashtirish va yaxshilash jarayonida sezilarli gen yo'qotilishi va genlar va promotorlarning kuchli salbiy tanlovini aniqladi.
Toʻliq maqolani www.seedworld.com saytida oʻqing.